В 1744 году живший в пещере при Китаевой пустыни монах Досифей подарил своему благодетелю - крестьянину из Пирогова - деньги, что получил от императрицы Елизаветы Петровны. На эти средства старая приходская церковь в Пирогово была заменена новой. В 1826 году здесь была построена каменная Крестовоздвиженская церковь. С приходом большевиков церковь была разрушена. В 1957 году Пирогово включено в состав Киева. На перекрестке улиц Краснознаменная и Лауреатская был установлен памятный крест, указывающий место разрушенного храма. С 2007 года возле обелиска павшим советским воинам в поминальные дни служились Панихиды. Возрождение храма началось с 2008 года. В 2009 году была выделена в аренду земля напротив входа на Пироговское кладбище. 27 сентября был освящен фундамент храма, а в конце ноября установлен временный храм. Постоянное богослужение совершается с Рождества Христова 2010 года. В январе 2011 года начато строительство нового деревянного храма, которое было окончено до Пасхи и первая Литургия состоялась на Пасху 2011 года.