Коледж морського і річкового флоту КДАВТ є правонаступником Київського суднобудівного технікуму заснованого в 1940 році згідно з наказом Народного комісара суднобудівної промисловості СРСР від 20 березня 1940 року №59/К.

В 1998 році навчальний заклад зазнав докорінної реорганізації, відповідно до Постанови Кабінету Міністрів України №1970 від 14.12.1998р., наказу Міністерства освіти України № 467 від 29.12.1998р. з 01 лютого 1999 року Київський суднобудівний технікум ліквідовано і створено Київську державну академію водного транспорту, до складу якої увійшов Суднобудівний технікум, як структурний підрозділ.

Розпорядженням КМУ від 29.01.2003р. Київській державній академії водного транспорту присвоєно ім’я гетьмана Петра Конашевича-Сагайдачного.

Відповідно до наказу Міністерства освіти і науки України від 02.06.2004р. №439 Суднобудівний технікум КДАВТ ім. гетьмана П.Конашевича-Сагайдачного реорганізовано у Коледж морського і річкового флоту КДАВТ ім. гетьмана П.Конашевича-Сагайдачного.